โรงเรียนกีฬาเทศบาลนครแม่สอด สังกัดเทศบาลนครแม่สอด ได้จัดตั้งขึ้นตามประกาศเทศบาลนครแม่สอด ณ วันที่ 30 กันยายน พ.ศ. 2559 ให้สร้างเป็นโรงเรียนกีฬาสังกัดเทศบาลนครแม่สอด โดยเริ่มแรกให้อาศัยพื้นที่ภายในโรงเรียนเทศบาลเฉลิมพระเกียรติสมเด็จพระเทพรัตนราชสุดาฯ สยามบรมราชกุมารี ชั่วคราว ซึ่งตั้งอยู่บนพื้นที่ 16-3-12 ไร่ ในเขตตำบลแม่ปะ ตามเอกสารสำคัญสำหรับที่หลวง เลขที่ 33264 โดยจัดให้มีการเรียนการสอนตามหลักสูตรแกนกลางการศึกษาขั้นพื้นฐาน ระดับมัธยมศึกษาตอนต้นและมัธยมศึกษาตอนปลาย เน้นความเป็นเลิศทางด้านกีฬาให้แก่เด็กและเยาวชนที่มีความสามารถพิเศษทางด้านกีฬาแต่ละประเภท ได้แก่ ฟุตบอล วอลเลย์บอล กรีฑา ตะกร้อ ยกน้ำหนัก และมวย

วัตถุประสงค์ในการจัดตั้งเพื่อให้บริการการศึกษาในระบบโรงเรียนแก่เด็กและเยาวชนในเขตเทศบาลและใกล้เคียง มุ่งที่จะพัฒนาเด็กและเยาวชนได้พัฒนาทั้งด้านร่างกาย จิตใจ อารมณ์ สังคม และสติปัญญา พร้อมทั้งส่งเสริมความเป็นเลิศทางด้านกีฬาให้ได้แสดงออกเต็มตามศักยภาพ และเพิ่มทางเลือกทางการศึกษาให้แก่เด็กและเยาวชน

โรงเรียนเปิดทำการเรียนการสอนครั้งแรกในปีการศึกษา 2561 ได้รับอนุมัติจากกรมส่งเสริมการปกครองท้องถิ่น กระทรวงมหาดไทย ให้เปิดขยายการจัดการศึกษาขั้นพื้นฐานของเทศบาลนครแม่สอด และเปิด ทำการสอนในระดับมัธยมศึกษา มีรหัสสถานศึกษา 3063200206 ตามหนังสือกรมส่งเสริมการปกครองท้องถิ่น ที่ มท 0816.2/6757 ลงวันที่ 27 มิถุนายน 2560